Этот модуль содержит полную реализацию процедур логлинейного анализа многовходовых таблиц частот. Могут анализироваться  таблицы с числом измерений до 7. Таблицы могут содержать структурные нули. Частотные таблицы могут быть вычислены по исходным данным либо введены непосредственно. Реализованный в модуле Логлинейный анализ универсальный набор мощных методов моделирования в сочетании с гибким интерактивным окружением принципиально упрощает проведение разведочного и подтверждающего анализа сложных таблиц. В любой момент пользователь имеет возможность просмотреть всю наблюдаемую таблицу целиком и маргинальные таблицы, подогнанные (ожидаемые) значения, оценить качество подгонки для всех ассоциированных частных и маргинальных моделей и выбрать для подгонки к данным специфическую модель (маргинальную таблицу). Для выбора модели в программе реализована автоматическая система интеллектуальной поддержки; сначала она определяет нужный порядок взаимодействия, обеспечивающий подгонку модели к данным, а затем, путем обратного исключения, находит наилучшую из моделей, достаточно хорошо (в смысле заданного пользователем критерия) аппроксимирующую данные. В стандартный набор результатов входят: статистика G-квадрат (отношение максимального правдоподобия хи-квадрат) и стандартная статистика хи-квадрат Пирсона с соответствующим числом степеней свободы и уровнями значимости, наблюдаемая и подогнанная (ожидаемая) таблицы, маргинальные таблицы и другие статистики. Графические средства модуля Логлинейный анализ включают большое число двух- и трехмерных диаграмм для визуального представления двух- и многовходовых частотных таблиц (в том числе - управляемые пользователем каскады категоризованных гистограмм и трехмерные гистограммы, показывающие "срезы" многовходовых таблиц), диаграммы наблюдаемых и подогнанных частот, диаграммы различных типов остатков (стандартизованные, компоненты отношения максимального правдоподобия хи-квадрат, отклонения Фримена-Тьюки и др.) и различные другие средства.